L'Agence d'évaluation de la recherche est chargée d'évaluer les activités de recherche conduites par les établissements publics, quel que soit leur statut, et par leurs unités de recherche. Elle donne un avis sur les procédures mises en place par les établissements pour évaluer leurs personnels et sur les conditions dans lesquelles elles sont mises en oeuvre. Elle participe également à l'évaluation des formations doctorales dispensées dans les établissements d'enseignement supérieur et de recherche.